Макарова признали виновным во взяточничестве, злоупотреблении должностными полномочиями, пособничестве в вымогательстве и пособничестве в мошенничестве. С 1998 по 2005 год Александр Макаров оказывал содействие своему знакомому предпринимателю в получении контроля над муниципальной собственностью — зданием торгового центра и земельным участком. За это, посчитало обвинение, тогдашний мэр получил взятку в виде доли в уставном капитале этого предприятия, приобретенной по заниженной стоимости.
Уголовное дело было возбуждено в 2006 году. Макарова приговорили к 11 годам и восьми месяцам колонии, а также к штрафу в 1 млн руб.