С 1 января 2014 года по 1 января 2015-го Буркхальтер также руководил Швейцарской Конфедерацией.
В 2014 году в качестве действующего главы Организации по безопасности и сотрудничеству в Европе (ОБСЕ) он активно участвовал в разрешении украинского кризиса. Именно ему принадлежала идея оснастить сотрудников миссии ОБСЕ в Донбассе беспилотными летательными аппаратами для мониторинга ситуации на линии соприкосновения.